Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHGAP10645 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHGAP10645 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHGAP10645 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHGAP10645 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms