Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB7P09629 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms