Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms