Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCO2O43819 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCO2O43819 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCO2O43819 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCO2O43819 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms