Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COCHO43405 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COCHO43405 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COCHO43405 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COCHO43405 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms