Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms