Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms