Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRBP1Q9P2E9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRBP1Q9P2E9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms