Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms