Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC11Q9BVV2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC11Q9BVV2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms