Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTKNQ9BST9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms