Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms