Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCMH1Q96GD3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms