Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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UBE2E3Q969T4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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UBE2E3Q969T4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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UBE2E3Q969T4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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UBE2E3Q969T4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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UBE2E3Q969T4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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UBE2E3Q969T4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2E3Q969T4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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