Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOPBP1Q92547 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOPBP1Q92547 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms