Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU79

SMAP2, Stromal membrane-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAP2Q8WU79 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAP2Q8WU79 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms