Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF548Q8NEK5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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