Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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LAMA3Q16787 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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