Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYPL1Q16563 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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