Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKIV2LQ15477 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms