Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms