Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TRAM2Q15035 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAM2Q15035 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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