Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms