Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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