Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MKRN3Q13064 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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