Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF2Q12933 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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TRAF2Q12933 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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