Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms