Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC15Q0P6D6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms