Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms