Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms