Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNEQ04844 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms