Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms