Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TMF1P82094 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMF1P82094 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMF1P82094 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMF1P82094 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMF1P82094 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMF1P82094 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms