Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIM1P81133 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIM1P81133 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIM1P81133 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms