Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK4P57078 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms