Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNT2P45379 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT2P45379 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms