Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms