Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PIK3CBP42338 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms