Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD12P35452 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms