Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms