Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms