Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB4P16144 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms