Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB1P14653 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms