Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA4P13612 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms