Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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