Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNMO15061 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNMO15061 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNMO15061 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNMO15061 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNMO15061 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNMO15061 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNMO15061 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNMO15061 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNMO15061 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNMO15061 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNMO15061 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms