Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms