Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms