Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WIPF3A6NGB9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms