Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNA3Q9UI47 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms